俱乐部生涯，佩佩2001年加入马德拉航海，并在球队效力三个赛季。2004年，佩佩加盟波尔图。效力波尔图的三个赛季，他共为球队出场87次。
佩佩俱乐部生涯最辉煌的时间是其效力皇马期间。2007年佩佩加盟皇马，共为球队效力10年。这10年间，佩佩共为皇马出战334场比赛。打进15球还有20次助攻，随队获得了3次欧冠冠军、2次世俱杯冠军、3次西甲冠军、2次欧洲超级杯冠军、2次国王杯冠军和3次西超杯冠军。
2017年佩佩离开皇马加盟贝西克塔斯。2019年他重回波尔图，并为球队效力至今。期间他共为球队出战201比赛。
职业生涯中，佩佩还赢得过4次葡超冠军。5次葡萄牙超级杯冠军，6次葡萄牙杯冠军和1次葡萄牙联赛杯冠军。
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